在排煙損失中，除了前面所述煙氣的物理熱損失之外，還有由于不完全燃燒而造成的化學熱損失。不完全燃燒除造成熱損失，降低熱效率外，還造成大氣污染。機械不完全燃燒產生的炭粒還會造成對流室爐管表面積灰，影響傳熱效果。

減少不完全燃燒損失的措施首先是選用性能良好的燃燒器，并及時的和定期的維護，使燃燒器長期保持在良好狀態下運行，以保證在正常操作范圍內能完全燃燒。其次是在操作中精心調節“三門一板”，以保證過剩空氣量既不太多，也不太少。

煉油加熱爐的燃燒器性能一般都較好，自動化控制水平也較高，因此不完全燃燒都較少。在設計和運行中通常都不考慮不完全燃燒損失。但對那些性能不良或維護不及時運行狀況不好的燃燒器，以及操作管理不精心的爐子來說，不完全燃燒損失則是不可忽略的。